Johann Gottfried Herder begegnete Jung-Stilling in Straßburg zu einer Zeit, in der dieser dort Medizin studierte. Herder war bereits als Theologe und Schriftsteller bekannt und wurde für Jung-Stilling zu einer geistig beeindruckenden Persönlichkeit. Die Begegnungen erweiterten dessen Horizont über das eigentliche Medizinstudium hinaus. Gemeinsam mit Goethe und dem Kreis um Johann Daniel Salzmann gehörte Herder zu jenem intellektuellen Umfeld, das Jung-Stillings Straßburger Jahre besonders prägte. Für das Verständnis Jung-Stillings ist diese Verbindung deshalb wichtig, weil sich in jener Zeit medizinische Ausbildung, religiöse Überzeugung, Literatur und allgemeine Gelehrsamkeit miteinander verbanden.